一是资金向生态区倾斜。将渝东南、渝东北生态发展区农村连片整治市级补助比例由20%提至40%。二是调整污水处理补助方式。将原补助污水处理厂建设转变为对建成投入运行给予补助。三是差别化补助湖库污染治理。按库容大小给予50-600万元不等的补助，结合湖库整治效果及与次级河流治理的关联情况给予一定补助。